曲靖市第二人民醫院前身為昆明紅十字會醫院（1965年改為昆明市第三人民醫院），始建于1928年，1970年由昆明搬遷至曲靖，改名為云南8511醫院，隸屬云南省國防科工辦，1986年移交曲靖地區，改名為曲靖地區第二人民醫院，1997年撤地設市，更名為曲靖市第二人民醫院，經云南省衛計委2015年3月20日正式批準為集醫療、教學、科研、預防、保健于一體三級甲等綜合醫院。為四川大學華西醫院/華西第二人民醫院區域聯盟網絡醫院，是云南中醫學院附屬曲靖綜合醫院、曲靖醫學高等專科學校的非直屬附屬醫院，2014年5月6日復旦大學附屬中山醫院對口援建曲靖市第二人民醫院正式啟動，承擔著全市638萬人民及周邊地區人民的醫療救治和突發公共衛生事件救治等任務。
醫院占地面積56畝，業務用房面積87902 m2，設有機關職能科室20個、臨床專業科室28個，醫技科室10個。其中肝膽外科于1991年2月率先在中國開展了“腹腔鏡膽囊摘除術”，享有“中國微創外科發源地”的美譽。全院現有職工1197人，在編人員510人，其中專業技術人員473人，教授30人，副教授98人，講師197人，碩士研究生35人，享有國務院特殊津貼1人，省政府特殊津貼2人，市政府特殊津貼8人，市級突出貢獻專業技術人員6人，市中青年學術技術帶頭人7人，曲靖市首席專家8人。醫院編制床位數800張，擁有1.5T超導核磁共振、多排螺旋CT、ECT、DSA、C臂X光機、DR系統、全自動生化分析儀等設備，2007年建成曲靖市首家靜脈藥物配制中心。2011年，建成省內一流的凈化手術室、數字化手術間及影像傳輸系統滿足臨床及學術需要，同年建成省內首家藥房自動化和小車軌道物流配送系統。
2009年以來先后獲評“全國五一勞動獎狀單位”,“全國醫藥衛生系統先進集體”,2009年、2012年連續兩屆榮獲“省級文明單位”。系上海消化內鏡診療工程技術研究中心曲靖基地、暨南大學微創外科研究所基地、廣州國際減重與糖尿病外科治療中心曲靖基地；上海消化內鏡診療工程技術研究中心?中山醫院?曲靖市二院合作中心、云南省住院醫師規范化培訓基地；系曲靖市微創外科臨床診療中心、曲靖市眼科疾病臨床診療中心、曲靖市健康體檢中心；肝膽外科、臨床護理專業為曲靖市臨床重點專科；普通外科、血液內科、消化內科專業為云南省省級重點專科建設項目。四級婦科內鏡技術、經皮冠狀動脈介入技術、永久性起搏器植入技術等12項二類技術獲準機構和人員資質準入。2007年以來有30余項科研成果獲省市級科學技術成果獎，其中2014年肝膽一外科《腹腔鏡肝葉切除的臨床研究》榮獲云南省政府科學技術獎三等獎。
