南方醫科大學口腔醫院，即原來的廣東省口腔醫院，始建于1962年，是廣東省最早建立的口腔醫院，也是我國最早建立的五大臨床口腔醫院之一。2017年1月1日起按照廣東省政府要求成建制劃轉南方醫科大學管理，名為南方醫科大學口腔醫院（廣東省口腔醫院、廣東省牙病防治指導中心、廣東省口腔醫學研究院）。南方醫科大學口腔醫院（廣東省口腔醫院）是華南地區建院歷史悠久、總體規模領先、技術力量雄厚，集醫療、教學、科研、預防為一體的區域性最具規模的大型口腔醫院。
醫院規模逐步擴大，現有六個院區，分別為總院區（院本部）、番禺院區、海珠廣場院區、盤福院區、順德分院、從化分院；一個下屬單位廣東粵誠牙科技術開發中心。醫院主辦中國科技核心期刊《口腔疾病防治》。
醫院內設33個業務科室、10個管理科室、8個醫技科室。在職教職員工1165人，其中高級職稱的專業技術人員167人，研究生導師33人，博士109人，碩士221人，留學歸國人員21人?，F有牙科綜合治療臺459張，開放床位數93張。
醫院作為專科口腔醫療機構，一直致力于服務質量和水平的提高，取得了顯著成效。2019年11月榮登“全國醫院互聯網影響力排行榜”口腔科第九名，是華南地區唯一上榜的口腔醫院。該榜單由中國社會科學院健康業發展研究中心等權威機構發布,共涉及29個?？?，研究數據覆蓋全國9852家公立醫院，509.4億次患者瀏覽軌跡，5700萬名患者在線問診記錄，3.1億次醫患交流，429.8萬條患者在醫院就診后的線上評價，是口腔醫院服務質量和水平的綜合體現。醫院立足華南、影響力輻射港澳臺地區及海外，2005年被評為“香港市民最信任的內地醫療機構”。
醫院擁有國內一流的口腔種植中心，年接診的種植患者數量近2萬，數字化種植修復技術位居國內領先水平；牙周病科以全國第二名的成績摘取“國家臨床重點專科”，成為第一批國家臨床重點專科；口腔正畸正頜治療中心綜合規模、技術力量處華南地區領先水平；醫院開展隱形矯治、兒童口腔舒適化治療、顯微根管治療、計算機設計與輔助的牙體修復、微創拔牙、特殊牙合 型總義齒及數字化全口義齒等新診療技術項目；擁有先進的數字化義齒加工設備；醫院在國內最早全面開展“牙科四手操作”服務，率先實現“一人一機一滅菌”。
2017年獲批廣東省口腔醫學研究院，擁有實驗室面積2500平方米。近三年獲得省部級科技進步二等獎1項、授權專利4件，承擔國家級科研項目12項，縱向課題資助總額達765.6萬元。發表SCI數據庫收錄的論文75篇，總IF值172.551。教學方面：近三年舉辦國家級、省級繼教項目30項，住院醫師規范化培訓及各級教學工作有序開展，共培養各級各類人才208人次。
醫院作為廣東省牙病防治指導中心，承擔指導全省口腔疾病防治規劃、實施、培訓指導和管理總結等任務。2019年被中國牙防基金會評為“整合資源，健康口腔——多模式口腔疾病防治”最佳管理單位，并被確定為“健康口腔指導中心”。
醫院牽頭成立南方醫科大學口腔醫院（廣東省口腔醫院）?？坡撁?，是廣東省首個口腔?？坡撁?，覆蓋全省，不定期向基層單位派駐醫療骨干，開展遠程會診及專業培訓等。從1995年開始連續成功舉辦了24屆華南國際口腔技術研討會，從2007年起連續成功舉辦13屆粵港澳臺口腔種植論壇，從2011年起承辦了5期東盟國家口腔醫療技術培訓班，此培訓班為國家科技部發展中國家技術培訓班項目之一。醫院是國家級住院醫師規范化培訓基地、是廣東省最先確立的國家醫師資格考試實踐技能考試與考官培訓基地、是中華口腔醫學會及北京大學醫學網絡教育學院口腔專業護士臨床實踐培訓基地及廣東省口腔?？谱o士培訓基地。
醫院下屬企業廣東粵誠牙科技術開發中心，為國家高新技術企業，是國內第一家大型國有義齒加工制作中心，在行業內率先通過了IS09001質量認證，承接國內外義齒制作和加工。
醫院主辦的口腔醫學學術類雜志---《口腔疾病防治》,1993年創刊，原名《牙病防治雜志》，1995更名為《廣東牙病防治》，2016年變更為現用名。為中國科技核心期刊，被美國Ulrichsweb、瑞典DOAJ、WHO西太平洋地區醫學索引（WPRIM）、波蘭《哥白尼索引》等多家國際重要數據庫收錄。
