北京大學(xué)深圳醫(yī)院原名“深圳市中心醫(yī)院”，是深圳市政府投資建成的現(xiàn)代化綜合性醫(yī)院。醫(yī)院于1999年底建成開業(yè)，2001年9月，深圳市政府與北京大學(xué)、香港科技大學(xué)合作，醫(yī)院更名為“北京大學(xué)深圳醫(yī)院”和“北京大學(xué)深圳臨床醫(yī)學(xué)院”，納入北京大學(xué)附屬醫(yī)院管理體系。2011年，經(jīng)廣東省醫(yī)院評審委員會評審，認(rèn)定為三級甲等醫(yī)院。
醫(yī)院占地面積5.9萬平方米，編制病床800張，實際開放病床1200張。2015年新外科大樓投入使用后，醫(yī)院總建筑面積將達(dá)22.3萬平方米，病床總數(shù)達(dá)1600-1800張。醫(yī)院總資產(chǎn)達(dá)11.3億元，擁有總價值超7.8億元的現(xiàn)代化醫(yī)療設(shè)備。現(xiàn)有在崗員工2059人，其中擁有副主任醫(yī)師以上職稱的高級技術(shù)人才681名，碩士以上學(xué)位人員535名，有海外留學(xué)經(jīng)歷人員112名。
醫(yī)院開設(shè)52個臨床醫(yī)技科室，其中1個國家級合作重點學(xué)科、8個省級臨床重點醫(yī)學(xué)專科、1個省級重點實驗室、8個市級重點學(xué)科及實驗室。醫(yī)院開展的一大批醫(yī)學(xué)高新技術(shù)和特色服務(wù)項目，吸引了深圳、香港、澳門以及周邊地區(qū)的大批患者，還有來自全球36個國家和地區(qū)的外賓前來就診。2014年醫(yī)院年門急診總量約295萬人次，年出院病人4.98萬人次，年手術(shù)量3萬多臺次。作為臨床醫(yī)學(xué)院，醫(yī)院設(shè)立了內(nèi)、外、婦、兒等二級教研室23個，三級教研室27個。年接收北京大學(xué)本科、研究生、臨床實習(xí)生50多名，其他實習(xí)、進(jìn)修人員100多名。現(xiàn)已建立博士后科研工作站1個，博士培養(yǎng)點5個，碩士培養(yǎng)點37個，共有碩士、博士導(dǎo)師108名。現(xiàn)承擔(dān)10多項國家、省自然科學(xué)基金項目，630多項國家、省部、市級科研課題，并獲得多項國家、省、市科技成果和國家專利。
醫(yī)院與北京大學(xué)、香港科技大學(xué)在技術(shù)和學(xué)術(shù)方面展開了廣泛的交流與合作，逐步拓展對外交流渠道。醫(yī)院與日本東京癌研有明病院、日本獨協(xié)醫(yī)科大學(xué)病院、南加州大學(xué)洛杉磯兒童醫(yī)院建立了姊妹醫(yī)院關(guān)系，并與國際知名的美國休斯頓醫(yī)學(xué)中心、華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)中心、麻省總醫(yī)院、加利弗尼亞大學(xué)舊金山醫(yī)學(xué)中心和法國尼斯醫(yī)學(xué)中心建立了密切的交流合作關(guān)系，并多次互訪增進(jìn)合作。
“仁心仁術(shù)，博學(xué)博愛”。伴隨這一使命和責(zé)任的傳承，年輕的北京大學(xué)深圳醫(yī)院將在“同享醫(yī)學(xué)成果，共度健康人生”的路上，執(zhí)著、堅定地不斷前進(jìn)！
