甘肅省腫瘤醫院、甘肅省醫學科學研究院為兩院一體的領導體制。始建于1972年。集醫療、科研、教學、腫瘤防治、康復、衛生信息化為一體,面向西北地區的大型醫學科研及腫瘤專業防治機構。承擔著甘肅省腫瘤診治、預防、腫瘤發病普查、醫學基礎、臨床研究及腫瘤專業人才培訓、大專院校教學實習、研究生培養等任務。
是三級甲等醫院，全國文明單位，國家博士后科研工作站，國家臨床重點專科腫瘤學建設單位，國家藥物臨床試驗機構，甘肅省癌癥中心，甘肅省重離子束治療腫瘤臨床研究基地，甘肅省腫瘤放射治療臨床醫學中心，蘭州大學附屬腫瘤研究中心，甘肅省省屬重點科研院所，蘭州大學生物學碩士研究生聯合培養基地，中華醫學會腫瘤學分會副主任單位，中國中西醫結合學會血液學專業委員會常委單位，中華中醫藥學會血液學分會常委單位，甘肅省醫學會腫瘤專業委員會主委單位，甘肅省醫學會放射腫瘤學專業委員會主委單位，甘肅省醫學會檢驗專業委員會主委單位以及甘肅省抗癌協會理事長單位等十余個協會主委單位，省、市、鐵路醫保單位，新農合定點醫院。
甘肅省腫瘤醫院開放病床1200張，設有19個臨床科室、7個醫技科室。其中，省級臨床醫學中心1個，省級重點學科4個(放射治療研究中心、頭頸外科、乳腺病診治中心、腫瘤內科)，甘肅省重點中醫專科1個(中西醫結合科)。臨床亞專業學科完善，覆蓋病種齊全。在腫瘤治療方面，形成了手術、放療、化療、介入、免疫、生物治療、中醫中藥、分子靶向、整形微創、核素治療等綜合體系。在國內率先開展的重離子治癌臨床研究取得重大成果，使我國成為繼美國、日本、德國之后開展重離子治癌臨床研究的第四個國家。與國內外30余所一流大學及研究機構建立了科研合作、人才交流協作關系。在提高療效，改善患者生活質量，控制惡性腫瘤復發與轉移方面均取得了良好成效，引領著甘肅省腫瘤臨床及科研水平的快速發展。
甘肅省醫學科學研究院由轉化醫學研究中心、醫學生物技術研究中心、分子生物學研究中心、藥物研究所、腫瘤流行病研究中心、醫學情報研究所和《甘肅醫藥》編輯部組成，擁有國家中醫藥管理局三級實驗室3個，省級科技創新團隊2個，藥物臨床試驗(GCP)機構1個。以“培養新型醫學科研人才、開展臨床導向技術研究、開放共享科研條件資源、促進生物醫藥領域合作”為目標，構建了轉化醫學研究平臺，腫瘤流行病學研究平臺，腫瘤分子生物學基礎研究平臺、地產中草藥研發平臺和醫學科技信息服務平臺。近年來圍繞腫瘤預防、發生發展的分子機制、腫瘤的分子診斷、抗腫瘤藥物和腫瘤個體化治療等領域積極開展基礎和臨床科學研究工作，促進了整體科研水平的提高，營造了良好的科技創新環境，有力地推動了我省腫瘤基礎和臨床研究工作的進程。
全院現有員工1248人，衛生專業技術人員1019人。其中，國務院特貼專家5人，國家臨床重點專科學術帶頭人1人，全國首批**中醫臨床人才1人，全國醫藥衛生先進個人1人，全國先進工作者1人，衛生部突出貢獻中青年專家1人，甘肅省“五一”勞動獎章獲得者1人，省級**專家4人，省級領軍人才6人，廳級領軍人才4人，甘肅省“333”、“555”跨世紀學術技術帶頭人，5人，甘肅省名中醫4人，省醫療衛生中青年學術技術帶頭人22人，省科技廳學科帶頭人2個，院聘首席專家4人，博士生導師3人，碩士生導師19人，博士、碩士145人。
配備了一大批具有國際先進水平的現代化臨床診療及科研設備。IGRT(圖像引導放射治療)等高精度放療直線加速器4臺，核通三維近距離后裝放療機2臺，東芝CT模擬定位機，X線模擬定位機，西門子Lantis、醫科達MOSALQ網絡、核通PLATO、Oncantra Masterplan、瓦里安Eclipse、醫科達CMS放療計劃系統6套。飛利浦64排128層 螺旋CT，西門子1.5T高場磁共振成像系統(MRI)，西門子大平板數字減影血管造影系統(DSA)，GE高分辨數字化X線攝影系統，西門子全數字化乳腺X線攝影系統(DR)。XE-5000全自動血細胞分析流水線，Sysmex Roche 全自動生化分析系統，Sysmex CA—7000 全自動血栓/止血分析儀，Versa TREK全自動血培養系統，全自動微生物鑒定及藥敏分析系統，以及中央監護系統，多普勒彩超，麻醉機，胸、腹腔鏡系統。還裝備了數字化全凈化手術室15間，重癥監護病房(ICU)，消毒供應中心。具有Quantstudio 12K多功能實時熒光定量PCR系統、FACSVerse流式細胞儀、Rotor-Gene實時熒光定量PCR儀、X-mark酶標儀、Agilent高效液相色譜儀、QIAGEN核酸自動提取儀等科研設備。
我院先后承擔并完成 “十五”“和十一五”國家科技攻關計劃、國家“973” 計劃項目子課題項目。近五年，共獲得各類科研立項126項，其中國家自然基金項目7項，國家重大公共衛生項目14項。全院共完成科研成果73項，發表論文595篇，其中SCI 49篇，國家級360篇。出版專著26部，獲得國家授權專利12項。全院共獲各類科技獎53項，其中省部級二等獎2項、地廳級科技獎52項。
