心包間皮瘤主要需與原發性良性間皮瘤、心包炎及心包轉移腫瘤相鑒別。
原發性良性間皮瘤(房室結之間皮瘤)：是自陷入房室結鄰近的胚性殘余間皮心包巢發生，因瘤塊有可能影響到心臟傳導系統的樞紐房室結的正常功能，故認為是能引起患者猝死的最小腫瘤。多見成年婦女。其生物學行為與發生自心包膜的間皮瘤不同。本病外科切除易引起心臟的傳導阻滯，最適當治療是房室起搏器。
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