本病病因尚不明確，故關于本病的病因學說很多：
一、生物力學因素
1、創傷學說：
在髕骨軟化癥致病因素中，創傷學說漸趨公認，包括直接創傷、間接創傷及各種反復作用超過關節軟骨生理范圍的物理應力，導致關節軟骨的"薄殼結構"和"拱形結構"破壞，軟骨細胞失去它們的保護而壞死，軟骨基質合成減少，導致關節軟骨進行性破壞。孔祥清等調查了996 名體育系大學生髕骨軟化癥患病率與運動創傷的關系，認為創傷是髕骨軟化癥的重要病因。
2、髕骨不穩定學說：
髕骨不穩定主要是指高位髕、低位髕、髕骨傾斜、髕骨半脫位或脫位。髕骨不穩可造成髕骨關節面上壓力增大、分布異常，引起軟骨損傷。盛蕾等在研究運動員髕骨軟化癥的CR 片后認為髕骨軟化癥患者髕骨軟骨在慢性損傷的基礎上，繼發關節囊及關節周圍肌肉改變，使關節面上生物力學平衡失調， 出現不同程度的髕股關節對位、對線及運動軌跡異常，使髕股關節負荷加大，加重軟骨損傷。
3、髕股壓力學說：
近年來隨著髕股關節生物力學研究的進展，對髕股壓力與髕骨軟化癥的關系出現了不同認識。長期來大多數學者都強調接觸高壓對髕骨軟骨軟化癥的影響。但用壓力過高學說難以解釋臨床上髕骨內側偏面為髕骨軟骨軟化癥高發區的現象。因此，有學者通過兔髕骨外側支持帶緊縮造成髕骨內側應力降低，致使深層軟骨細胞和周圍基質變性。近年來髕股關節壓力分布不均也受到重視，甚至有學者認為應力失衡是軟骨退變的原因，糾正應力失衡狀態，恢復關節面的均勻接觸是治療各種病理力學因素導致軟骨退變的根本方法。
二、生物化學因素
1、自身免疫學說：
關節軟骨表面能阻止抗膠原抗體進入軟骨深層組織而對其有保護作用。在關節軟骨損傷病人的關節液中發現有抗Ⅱ型膠原的抗體，免疫熒光方法檢查髕骨軟化癥患者的病變標本，發現軟骨組織損壞區域及殘存的軟骨細胞上有免疫球蛋白IgG、IgA、IgM和補體C3 附著。由此推斷在軟骨損傷過程中有自體免疫反應參與。
2、軟骨營養障礙：
各種致傷因素( 特別是機械刺激) 使關節液的分泌及其成分( 如酶的活性、各種營養物質的含量、關節液的滲透壓等) 發生異常變化， 影響髕軟骨正常的營養和生理生化過程，促使軟骨變性而發病。由于關節骺軟骨復合體中骺軟骨的生存力高度依賴于軟骨血管的血流供應，故血供不足也是髕骨軟化癥的病因之一。
3、軟骨溶解學說：
關節滑膜受傷后滲透壓改變，血漿中的酶進入滑液增多、活性增強，進而溶解軟骨。我國學者亓建洪發現：
?、袤x骨軟骨軟化過程中，軟骨細胞合成大量的膠原酶并釋放到軟骨基質中造成嚴重破壞;
②膠原酶含量與應力降低的髕骨內側面軟骨變性的嚴重程度呈正相關。
因此，膠原酶在接觸應力降低的髕骨內側面軟骨軟化過程中起重要作用。目前，多數學者傾向于認為髕骨軟化癥是多種因素綜合作用的結果，各種因素致髕股關節壓力改變是外因，自身免疫反應、軟骨營養障礙是髕骨軟化癥發生的內因。
