治療濕疹
夏天皮膚容易出現問題，一個是因為潮濕，還有一個如果自身濕氣太重，也會有所表現，比如皮膚上出現濕疹，還有過敏。這個時候就可以將藿香正氣水直接涂抹在身上，或者在洗澡的時候兌在水中，之后不要清洗，盡量讓藥液自然干燥。這個過程就可以產生局部治療的效果。
去頭癬、手足癬和灰指甲
藿香正氣水中的藿香、紫蘇、白芷、桔梗分別對多種致病真菌有較強的抑制作用，故而對頭癬、手足癬、灰指甲有較好的療效。將適量藿香正氣水滴入洗澡水中，用來泡澡，可以有效的治療真菌引起的疾病，也可用藿香正氣水涂擦患處，
去痱子
中醫認為痱子由表熱夾濕引起，而藿香正氣水有解表祛熱除濕的功效，所以對痱子有良效，配合止汗爽身粉療效更佳。尤其對于小孩子來說，可以在他們的洗澡水中滴入幾滴藿香正氣水，可以有效的防止小孩長痱子。
治療外陰瘙癢
因藿香正氣水是由抗多種致病菌和殺滴蟲的藿香、紫蘇、白芷、生姜等藥組成，故治療外陰痞癢有較好的療效。以藿香正氣水：兌涼開水清洗外陰，男女皆可用。不但有止癢療效，而且有一種清爽感。因此，藿香正氣水的稀釋液也可以充作性器官的保健清洗劑。
抑菌、抗病毒
厚樸有廣泛抗菌作用，其抗菌成分較穩定，不易被熱、酸、堿等所破壞。試驗證明，其對金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌、痢疾桿菌等均有抑制作用。紫蘇對大腸桿菌、痢疾桿菌、葡萄球菌等亦有抑制作用。藿香所含廣藿香酮則對金黃色葡萄球菌、綠膿桿菌、大腸桿菌、痢疾桿菌、甲型溶血性鏈球菌、肺炎雙球菌，均有抑制作用。
